一體化污水處理設備調試結束后，方可正常進行，正常運行有控制柜自動進行，按設備處理量進水曝氣。一體化污水處理設備運行中必須使氣量達到正常運行量。正常運行時污水所需氣量一般為污水的12-15倍。消毒池內加藥斗加適量氯片，并旋轉調整加藥到合適加藥量，一般生活污水加藥量為2-3克每噸污水，如醫院污水則為8-12克每噸污水，工業污水視水質確定投加消毒氯片。（具體均應視進水水質及出水水質作適當調整）。云南一體化污水處理設備定期進行水質監測并設置為一星期加一次藥。運行過程中對水泵和風機要進行檢查，格柵上有大的雜物要清理，以免損傷水泵。
